微生物可以分为原核微生物、真核微生物和非细胞结构微生物三类，也可以分为细菌、病毒、真菌、放线菌、立克次氏体、支原体、衣原体、螺旋体八种。
原核生物是指一类细胞核无核膜包裹，只要称作核区的暴露DNA的原始单细胞生物。它包含细菌、放线菌、立克次氏体、衣原体、支原体、蓝细菌和古细菌等。它们都是单细胞原核生物，结构简略，没有细胞器结构，个别细小，一般为1～10 m，仅为真核细胞的十分之一至万分之一。
真核生物是一类细胞核具有核膜，能进行有丝分裂，细胞质中存在线粒体或一起存在叶绿体等多种细胞器的生物。菌物界的真菌、黏菌，植物界中的显微藻类和动物界中的原生、后生动物等都是归于真核生物类的微生物。
非细胞型微生物是结构最简略和最小的微生物，它体积细小，能经过除菌滤器，没有典型的细胞结构，无发生能量的酶系统，只能在宿主活细胞内成长增殖的微生物。
一、细菌（学名：Bacteria）是生物的首要类群之一，归于细菌域。也是一切生物中数量最多的一类，据估量，其总数约有5×10^30个。细菌的形状适当多样，首要有球状、杆状，以及螺旋状。
二、病毒是一种个别细小，结构简略，只含一种核酸（DNA或RNA），有必要在活细胞内寄生并以仿制方法增殖的非细胞型生物。病毒是一种非细胞生命形状，它由一个核酸长链和蛋白质外壳构成，病毒没有自己的代谢组织，没有酶系统。
三、真菌，是一种真核生物。最常见的真菌是各类蕈类，别的真菌也包含霉菌和酵母。现在现已发现了七万多种真菌，估量仅仅一切存在的一小半。大多真菌原先被分入动物或植物，现在成为自己的界，分为四门。
四、放线菌，是一类首要呈菌丝状成长和以孢子繁衍的陆生性较强壮的原核生物。因在固体培育基上呈辐射状成长而得名。大多数有兴旺的分枝菌丝。菌丝纤细，宽度近于杆状细菌，约0.5～1微米。
五、立克次氏体（Rickettsia）为革兰氏阴性菌，是一类专性寄生于真核细胞内的G-原核生物。是介于细菌与病毒之间，而接近于细菌的一类原核生物。一般呈球状或杆状,是专性细胞内寄生物，首要寄生于节肢动物。
六、支原体（mycoplasma）是一类没有细胞壁、高度多形性、能经过滤菌器、可用人工培育基培育增殖的最小原核细胞型微生物，巨细为0.1～0.3微米。因为能构成丝状与分枝形状，故称为支原体。
七、衣原体（chlamydia）是一组极小的，非运动性的，专在细胞内成长的微生物。衣原体可分为4种，即肺炎衣原体、鹦鹉热衣原体、沙眼衣原体和牛衣原体。衣原体为革兰阴性病原体，是一类能经过细菌滤器、在细胞内寄生、有共同发育周期的原核细胞性微生物。
八、螺旋体（spirochete）是一类细长、柔软、曲折呈螺旋状、运动生动的原核细胞型微生物。在生物学方位上介于细菌与原虫之间。螺旋体在自然界中散布广泛，常见于水、土壤及糜烂的有机物上，亦有的存在人体口腔或动物体内。
微生物包含：细菌、病毒、真菌以及一些小型的原生生物、显微藻类等在内的一大类生物集体，它个别细小，与人类关系密切。涵盖了有利跟有害的很多品种，广泛触及食物、医药、工农业、环保、体育等许多范畴。
在我国大陆地区及台湾的教科书中，均将微生物划分为以下8大类：细菌、病毒、真菌、放线菌、立克次氏体、支原体、衣原体、螺旋体。有些微生物是肉眼可以看见的，像归于真菌的蘑菇、灵芝、香菇等。还有微生物是一类由核酸和蛋白质等少量几种成分组成的“非细胞生物”，但是它的生计有必要依赖于活细胞。
一个别积稳定的物体，被切开的越小，其相对表面积越大。微生物体积很小，如一个典型的球菌，其体积约1mm，但是其表面积却很大。这个特征也是赋予微生物其他如代谢快等特性的根底。
微生物一般具有极端高效的生物化学转化才能。据研讨，乳糖菌在1个小时之内可以分化其本身分量1000-10000倍的乳糖，产朊假丝酵母菌的蛋白组成才能是大豆蛋白组成才能的100倍。
比较于大型动物，微生物具有极高的成长繁衍速度。大肠杆菌可以在12.5-20分钟内繁衍1次。但事实上，因为各种条件的约束，如养分缺失、竞赛加重、生计环境恶化等原因，微生物无法彻底到达这种指数级增加。 已知大多数微生物成长的最佳pH规模为7.0 (6.6~7.5)邻近，部分则低于4.0。
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